Circoncnranet——一种集成的基于Web的资源,用于映射长形或圆形非编码RNA的功能网络。bepaly买球

尽管它们缺乏蛋白质编码潜力,bepaly买球lncRNas和circRNas已经成为基因调控的关键决定因素。调节转录和信号输出。已知这些非编bepaly买球码RNA转录物通过表观遗传和转录后调控影响信使RNA(mRNAs)的表达。考虑到它们广泛的目标光谱和广泛的作用方式,全面了解它们的生物学相关性将取决于对不同层次的系统数据进行综合分析。

虽然已经报告了一些公开可用的数据库,现有工具无法完全捕获,从网络的角度来看,感兴趣的lncRNas或circRNas的功能含义。bepaly买球通过一个集成的、流线型的设计,Circlincnranet旨在通过在硅片中测试基于ncrna的函数的几个假设来扩大对ncrna候选对象的理解,基于大规模的RNA序列数据。该网络服务器实现了几个代表NCRNAS生物信息学进展的功能:1)接受和处理基于用户定义的NGS表达式数据的灵活框架;2)多个分析模块,通过交叉引用广泛策划的数据库,分配和有效评估用户选择的NCRNA的监管网络;3)多用途,为所有类型的NCRNA量身定制的信息丰富的工作流设计。表达式配置文件的输出,共表达网络与途径,分子间相互作用,根据用户定义的标准动态交互显示。

循环网络的总体设计与分析流程

RNA序列简而言之,用户可申请Circoncnnet获取,实时地,关于其感兴趣的circrnas/lncrna的多行功能相关信息。bepaly买球综上所述,Circoncnranet提供了一个“一站式”NCRNA生物学深入分析资源。

可利用性–Circoncnranet可在http://app.cgu.edu.tw/circlnc/.

Wu SMLiu HHuang PJChang IYLee CCYang CYTsai WSTan BC。(2017) Circoncnranet:一种集成的基于Web的资源,用于映射长形或圆形非编码RNA的功能网络。bepaly买球. 千兆科学[印刷前电子版]。[ 摘要]

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