结直肠癌长链非编码RNA位点表观遗传模式的综合分析

结直肠癌是世界上最常见和最严重的癌症之一。结肠鳞癌的发生是由结肠细胞的遗传和表观遗传改变的积累而形成的。过去十年的研究表明,表观遗传的变化,如DNA甲基化,蛋白编码基因组蛋白修饰在结直肠癌的发生发展中起着重要作用。然而,CRC中lncRNas的表观遗传模式和特征尚不清楚。bepaly买球

在这里,研究人员来自宁波大学全面分析DNA甲基化的模式,H3K4me3,H3K27me3在蛋白编码基因和lncrna上的表达。bepaly买球他们发现了一些有趣的结果,这些结果可能有助于区分lncrnas和蛋白质编码基因。bepaly买球例如,在蛋白编码基因上,DNA甲基化和H3K4me3信号高于lncrna,bepaly买球但不是H3K27me3;三种表观遗传标记在启动子上分布不同,终止和整个基因之间的蛋白质编码基因和lncrna,bepaly买球尤其是DNA mathylation,根据基因转录的原理表现出规律性的信号趋势。此外,他们进一步分析了表观遗传标记对HCT116结肠细胞蛋白质编码基因和lncRNA表达的影响。大多数结果与以前的报告一致,如H3K27ME3是一个抑制性标记。此外,研究人员分析了这三个表观遗传标记之间的关系,发现DNA甲基化和H3K4me3在蛋白质编码基因和lncrnas的启动子和终止区均呈正相关。bepaly买球

lncRNA

在TSS和TTS周围不同表达水平的蛋白编码基因和lncrnas上表观遗传标记的信号趋势。bepaly买球蛋白质编码基因和lncRNas根据其表达水平分为11个水平bepaly买球。0级包括没有表达的基因。1-10级包括10%的左基因,10级包含最大表达的基因。a-f是TSS周围的信号趋势,h-m是TTS周围的信号趋势。

廖Q,Chen LLiu J杨,李J,张X,赵J。(2016) 结直肠癌长链非编码RNA位点表观遗传模式的综合分析. 基因[Epub before print]。( 摘要]

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