长非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌中的表达

尽管有超过35000个不同的lncrna序列,但对于其在皮肤鳞状细胞癌(CSCC)中的分子病理作用,人们知之甚少。

在一项由波鸿鲁尔大学,在CSCC和对照组(n=6)中,用阵列式人lncrna微阵列测定lncrna和mRNA表达谱。对基因和基因组的京都百科全书进行了路径丰富和基因本体分析。差异表达分析显示,与对照组相比,CSCC中有1516个上调的lncrnas和2586个下调的lncrnas。bepaly买球数据分析确定了已知的致癌基因lncRNas,bepaly买球比如hox转录反义RNA hotair,在差异表达的lncrna序列中。京都基因百科全书和基因组路径分析显示,局灶性粘附,细胞外基质和致癌磷脂酰肌醇3′-激酶Akt信号通路的富集度最高。

基因本体和Kegg通路分析结果

LNCRNA

基因本体研究结果(A—C)凯格(d)路径分析显示不同表达的mRNAs的功能分类(p值≤0.05;折叠变化≥2.0)。基因本体分类为(a)生物过程,(b)细胞成分和(c)分子功能。ECM:细胞外基质;京都基因和基因组百科全书。

这项研究为在CSCC中差异表达lncRNA提供了第一个证据,并作为进一步研究的模板。对CSCC分子lncRNas进行更深入的功能分析。bepaly买球

砂米,贝沙拉砂D甘比克勒T哈恩萨Bromba MStockfleth E海森姆S(2016) 长非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌中的表达. 表观基因组学[印刷前电子版]。[ 摘要]

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