HIV-1感染过程中上调的长链非编码RNA的鉴定与鉴定bepaly买球

长链非编码bepaly买球rna (lncrna)正迅速成为bepaly买球多种细胞功能的重要调控因子。在这里,哥伦比亚大学研究人员描述了两项独立RNA-seq研究的荟萃分析,以识别在HIV-1感染时差异表达的lncrna。bepaly买球只有三个lncRNA基因表现出改变表达式HIV-1-infected≥2倍的细胞。其中,选择未表征的lncRNA LINC00173进行进一步研究。通过qPCR检测LINC00173 (lnc173 TSV1和2)的两个转录变异,主要定位于细胞核,在感染过程中可重复上调。LINC00173位点的敲除对HIV-1的复制没有可检测到的影响。有趣的是,然而,PMA/ionomycin刺激Jurkat T细胞使lnc173表达降低,lnc173缺失的Jurkat细胞平均表达的特异性细胞因子水平高于对照细胞。这些数据表明lnc173可能在T细胞细胞因子的调控中发挥作用。

在网上分析LINC00173与活性转录一致吗

lncRNA

(一)RNA-seq在LINC00173位点的表达数据和保守性。UCSC基因组浏览器获取和可视化的数据(http://genome.ucsc.edu)。(c)(B) lnc173转录本变体1 (TSV1)和(C) lnc173 TSV2二级结构预测。资料来源:LNCipedia (www.lncipedia.org)

Postler TS,储藏室锡、Desrosiers RC,Ghosh年代。(2017) HIV-1感染过程中上调的长链非编码RNA的鉴定与鉴定bepaly买球病毒学511:30-39 [Epub before print]。( 摘要]

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