基于相关蛋白-蛋白相互作用分析识别结直肠癌进bepaly买球展中的关键lncrna

结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一。CRC进展的分子机制尚不清楚。越来越多的证据表明,长链非编码rna (long noncoding RNAs, lncrna)在肿瘤的发生、发bepaly买球展和转移过程中起着重要的作用。研究人员复旦大学目的探讨lncrna在CRC进展中的作用。bepaly买球

在这项研究中,研究人员通过分析一组以前发表的数据集:GSE64857,旨在识别CRC中差异表达的lncrna和信使rna (mrna)。bepaly买球我们应用GO和KEGG通路分析来深入了解这些lncrna和mrna在CRC中的功能。bepaly买球

共鉴定46个lncrnabepaly买球在II期和III期CRC中有差异表达。GO和KEGG pathway分析显示,差异表达的lncrna参与了信号转导、细胞粘附、细胞分化、局灶性粘附和细胞粘附分子的调控。bepaly买球

lncRNA

结直肠癌II期与III期共表达DEG-lncRNA网络的构建一种共有46个lncrna和bepaly买球881个差异表达基因在网络中聚集

研究人员发现三种lncrna (LOC100129973bepaly买球, PGM5-AS1, TTTY10)与差异表达的mrna广泛共表达。他们还在CRC中构建了lncrna相关的PPI,发现这些lncrna可能与CRC进展相关。bepaly买球此外,他们还发现,高水平的PGM5-AS1表达与CRC癌症的整体生存更差相关。研究人员认为,这项研究将为CRC提供新的潜在治疗和预后靶点。

朱H,俞Ĵ,朱H,郭Y,冯S.(2017) 基于相关联的蛋白质 - 蛋白质相互作用分析中bepaly买球结肠直肠癌症发展的关键lncRNAs的鉴定。 世界日报肿瘤外科[打印的打印前。[ 文章]

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