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长非编码Rbepaly买球NA(lncrnas)正在成为细胞bepaly买球生理学的重要调节因子。但尚不清楚lncRNAs进化到何种程度成为microRNAs的靶向。bepaly买球比较基因组学先前揭示了蛋白质编码mRNAs的广泛进化保守的microRNA靶向性,在这里,我们对lncrnas应用了类似的方法。bepaly买球

哥德堡大学的研究人员,瑞典使用了一张在lncrnas中假定的microrna靶点的地图,在那里根据46种脊椎动物评估了位点保护。bepaly买球他们将观测到的目标频率与随机模型得到的频率进行了比较,在可变预测临界点。虽然基因间lncRNa的保守位点没有超过随机预期,bepaly买球他们观察到细胞质lncrnas的一小部分高度保守的8-mer位点的边缘过度表达(8个lncrnas中的12个位点的错误发现率为56%,bepaly买球p=0.10)。

lncrnas中的进化保育率一般较低,但分片性较高。bepaly买球这些补丁可以,原则上,港口保护目标地点。然而,虽然我们的分析有效地检测到了mRNAs的保守靶向性,它仅为保守的microrna-lncrna相互作用提供有限且微显著的支持。研究人员得出结论,用他们的方法不能可靠地检测到保守的microrna-lncrna相互作用。

  • 阿莱·马哈巴迪B,拉尔森E.(2013年)有限的证据表明,通过micrornas对长的非编码RNAs进行进化保守的靶向。bepaly买球.沉默[印刷前电子版]。[文章]

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