lncident–快速识别长非编码RNA的工具

越来越多的研究表明长非编码rna (lncRNAs)扮演关键角色的多样性生物过程,也与多种疾病有关。bepaly买球如何快速识别lncrnas和信使RNA是揭示lnbepaly买球crnas识别功能的基本步骤。

研究人员吉林大学基于支持向量机模型,开发了一种利用序列固有成分特征和开放式阅读帧信息快速识别lncrna的新方法。bepaly买球命名为lncident(lncrnasbepaly买球标识)。采用10倍交叉验证和ROC曲线评价反应器的性能。本发明的主要优点是速度快,不损失准确度。与退出流行的工具相比,进取心强于编码电位计算器,,编码潜力评估工具,,Coding-Noncoding指数,和普莱克.Lncident也远远高于Coding-Potential计算器和Coding-Noncoding指数。本品在微生物方面表现突出。这提供了一个微生物的应用前景分析。此外,事件可以由用户自己收集的数据进行培训。此外,R包和Web服务器同时开发,以最大限度地为用户提供便利。

Lncident框架:包含数据收集,,
特征提取,分类模型构造,和模型评估

LNCRNA

可利用性–R包”Lncident”可在http://csbl.bmb.uga.edu/mirrors/jlu/lncident/index.php,适用于多种操作系统平台。可通过以下方式访问事件的Web服务器:http://csbl.bmb.uga.edu/mirrors/jlu/lncident/annotate.php.

汉斯Liang Y李Y杜威(2016) 事件:利用序列固有成分和开放阅读框信息快速识别长非编码RNA的工具。. Int J基因组学2016:918596.( 文章]

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