bepaly买球lncrnasnp–lncrnas中snps及其潜在功能的数据库

长非编码Rbepaly买球NA(lncrnas)在不同的细胞bepaly买球环境和不同机制的疾病中发挥着关键作用。随着已鉴定的lncRNas和疾病相关单核苷酸多态性(snps)的快速增长bepaly买球,研究lncrnas的单核苷酸多态性有很大的需求。bepaly买球旨在提供有关lncrna单核苷酸多态性的有用资源,研究人员来自华中科技大学系统地鉴定了lncrna中的单核苷酸多态性,并分析了它们对lncrnbepaly买球a结构和功能的潜在影响。总而言之,他们在人类和小鼠的30000多个lncrna转录物中鉴定出495729和777095个单核苷酸多态性。分别。大量的单核苷酸多态性被预测有可能影响小RNA-lncrna相互作用。小RNA-lncRNA相互作用的实验证据和保护,除了TCGA中的小RNA表达外,还整合了小RNA-lncrna相互作用和结合位点上的单核苷酸多态性。此外,通过将SNP映射到GWAS结果,他们发现142个人类lncrna单核苷酸多态性是Gwas-Tagsnps,197827个lncrna单核苷酸多态性位于Gwas连锁不平衡区域。所有人类和小鼠lncrnas的数据都被导入lncrnasnp数据库,bepaly买球其中包括两个子数据库lncrnasnp人类和lncrnasnp小鼠bepaly买球。lncrbepaly买球nasnp数据库有一个用户友好的界面,用于搜索和浏览snp,lncrna和mirna切片。

LNCRNA

可利用性-lncrnbepaly买球asnp数据库可从以下网址获得:网址:http://bioinfo.life.hust.edu.bepaly买球cn/lncrnasnp/

  • 龚杰,Liu WZhang J苗X郭娥。(2015)bepaly买球lncrnasnp:lncrnas中的snps数据库及其在人和小鼠中的潜在功能.核酸研究43(数据库问题):D181-6。[文章]

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