lncrnatargets——基于核酸热力学的lncrna目标预测平台

许多研究支持长非编码RNA(lncrnas)在各种关键生物学过程中发挥各种功能。bepaly买球先进的实验和计算技术允许访问有关lncrnas的更多信息。bepaly买球迫切需要大规模地确定这些区域导航系统的功能和作用机制。

北京协和医学院的研究人员已经开发出了lncrnatargets,它是基于核酸热力学的lncRNA靶点预测网络平台。采用最近邻(NN)模型计算宾格自由能。核酸神经网络模型的主要原理是假设相邻碱基对的同一性和方向决定了给定碱基对的稳定性。lncrnatargets具有以下选项:设定一个特定的温度,不仅可以用于人类,也可以用于其他动物或植物;在高吞吐量下处理所有lncrnbepaly买球as,无RNA大小限制,优于任何其他现有工具;基于网络的,用户友好界面,彩色结果显示,使非熟练的计算机操作人员更容易访问,并提供更好的结果理解。该技术可以准确计算lncrna靶二聚体的结合自由能,预测这些结构是否具有良好的靶向性。

lncrnaTargets生成的示例结果页

北卡罗来纳州

所有结果将根据Δg阈值以绿色和红色的表格显示。可以单击每一行以显示对齐图。

可利用性–lncrnatargets提供高精度计算,这个用户友好的程序在http://www.herbbol.org:8001/lrt/

Hu R太阳X。(2016年) 核酸靶:基于核酸热力学的核酸靶预测平台。 生物信息计算机生物[印刷前电子版]。[ 摘要]

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