黑色素瘤细胞中安瑞尔的多种亚型:结构复杂性提示加工过程的变化

长的非编码RNA-bepaly买球Anril,对CDKN2B位点的反义,是从包含多种疾病相关多态性的基因转录而来。尽管已鉴定出安利的多种亚型,某些转录本的表达被发现是组织特异性的,ANRIL转录本的特征仍然不完整。ANRIL具有多种功能。在我们的判断,对ANRIL功能的研究尚不成熟,有待于对大量亚型的更完整认识。

研究人员来自奥克兰癌症协会研究中心发现ANRIL exons的差异表达,这表明黑色素瘤细胞中存在多种亚型。除了线性亚型外,他们鉴定出了环纹杆(circanril)的圆形。circANRIL在两种患者来源的转移性黑色素瘤细胞系(NZM7和NZM37)中的进一步特征显示存在丰富的圆形亚型。此外,在研究的两个黑色素瘤细胞系中,circANRIL亚型的互补几乎完全不同。也发现了新的外显子。研究人员还发现,线形ANRIL家族在细胞核中含量丰富,而圆形亚型在细胞质中丰富,在稳定性上有显著差异。关于环孢菌的变种加工,生物信息学分析表明,内子Arthrobacter luteus (Alu)限制性内切酶反向重复和外显子跳跃不参与背剪接外显子连接的选择。

功能概述安瑞尔和途径

LNCRNA

相关通路示意图安瑞尔安瑞尔通过抑制p15P16KLF2P21通过prc1和prc2复合物。安瑞尔由NF-κB通路的激活,诱导与转录因子形成复合物YY1对炎症基因进行转录调控白细胞介素6IL8安瑞尔在DNA损伤后由转录因子E2F1以ATM依赖性方式上调,以及更高水平的安瑞尔抑制的表达式CDKN2A / B在DNA损伤反应的后期阶段,使细胞在DNA修复完成后恢复正常。绿色的线表示诱导,红色的线表示抑制。

基于这些发现,研究人员假设“ANRIL”在黑色素瘤中具有完全不同的双重功能。这揭示了基因座的动态性质,为研究ANRIL在黑色素瘤中的作用奠定了基础。

Sarkar D奥加比ABodiyabadu PK,约瑟夫WR,梁,芬利GJ,BaululeBC阿斯卡里安·阿米里。(2017) 黑色素瘤细胞中ANRIL的多种亚型:结构的复杂性暗示了处理过程的变化。 国际标准语SCI18(7):E1378。[ 文章]

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