用于解码RNA相互作用网络的Starbase v2.0

Starbase V2.0用于解码小RNA mRNA,微小RNA米娜·lncrna,小RNA环RNA,剪接序列(hits-clip,剪辑,ICLIP,冲突)数据。

Starbase 2.0版还提供了可视化功能,分析,发现并下载上述大规模功能基因组学数据。

小RNA-lncrna相互作用描述

你可以通过扫描lncrna序列与剪接序列峰重叠的潜在microrna目标(6mer-8mer)来浏览预测的microrna-lncrna相互作用,然后输出详细信息。在这里,我们只列出了与clip-seq数据重叠的预测的小RNA靶相互作用。

LNCRNABASE

Li JH刘先生,周H,Qu Lh*和Yang JH*。(2013年)Starbase 2.0版:解码microrna cerna,大片段序列数据中的小RNA-ncrna和蛋白质-rna相互作用网络。提交。

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