lncRNA AK144841可能参与导致肿瘤发展的分子级联

角化细胞来源的皮肤鳞状细胞癌(cSCC)是最常见的转移性皮肤癌。虽然一些早期的病理事件已经被确认,导致肿瘤发展的后续步骤尚未明确。的研究人员蔚蓝海岸大学在此证明,同时应用致癌物质和肿瘤启动子(7,12二甲基苯[a]蒽[DMBA]和12- o -十四烷基酚-13-醋酸酯[TPA])诱导小鼠肿瘤的发展,分别)与之前未鉴定的长链非编码RNA (lncRNA)的上调有关,称为AK144841。他们发现AK144841表达在正常皮肤中缺失,在肿瘤和高致瘤细胞中受到特异性刺激。他们还发现AK144841有两种变体,一个是由4个外显子组成的2 kb的大转录本,另一个是缺少第二个外显子的1.8 kb转录本。功能得失研究表明,AK144841主要抑制基因表达,特别是下调参与表皮末梢分化的晚羊角化包膜-1 (Lce1)家族基因的表达以及Cgref1等抗癌基因的表达,Brsk1,Basp1,ptpn -Btg2,Anpep,Dhrs9,Stfa2,Tpm1,SerpinB2,Cpa4,Crct1,Cryab,Il24,Csf2,和Rgs16。有趣的是,第二外显子的缺失显著降低了AK144841对基因表达的抑制作用。研究人员还指出,AK144841的高表达与上述基因的低表达以及细胞系的致瘤潜能有关。这些结果表明,AK144841可能有助于肿瘤形成角化细胞的去分化程序和导致肿瘤发展的分子级联。

AK144841沉默对mSCC-38细胞转录组的影响

lncRNA

MSCC-38细胞转染2个不同的针对AK144841 (Si1AK-Si2AK)的sinas和一个对照siRNA (SiC)。转染48小时后使用pan基因组芯片(Agilent公司GE 8x60K芯片)测定基因表达谱。图中为在不同实验条件下AK144841 siRNA对129个基因表达进行统计学调控后的归一化log2强度的热图。选取热图上表达的129个上调和下调基因的阈值为平均表达量> 7.0;绝对对数FC > 0.6;调整后的pvalue < 0.05。NT(1-4) = 4个未转染mSCC-38的样品。SiC(1-3) = 3个转染非相关siRNA (SiC)的mSCC-38样品。Si1AK(1-4) = 4个转染Si1AK的mSCC-38样品,第一个ak144841特异性siRNA。Si2AK(1-3) = 3份转染Si2AK a second AK144841 siRNA的mSCC-38样品

Ponzio G,Rezzonico R,我到处游荡,艾伦R,Nottet N,Popa,Magnone V,里奥斯克,玛丽,Barbry P。(2017) 在皮肤鳞状细胞癌中诱导一种新的长链非编码RNA (LncRNA),并下调小鼠的几种抗癌和细胞分化基因J临床生物化学[Epub before print]。( 文章]

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