CHO细胞长的非编bepaly买球码RNA转录组结构

非编码RNA在决定生长中bepaly买球的作用,生产力,近年来,中国仓鼠卵巢(CHO)细胞的重组产物质量属性受到了广泛关注。尤其是micrornas的研究。然而,其他类别的非编码RNA受到的关注较bepaly买球少。其中一类是非编码RNA,统称为长非编码RNA(bepaly买球lncrnas)。bepaly买球

研究人员在肯特大学已经使用基于小鼠的微阵列对CHO的lncrna转录组进行了首次景观分析,该微阵列也提供了对编码转录组的监测。他们在两个不同的日期报告了在分批和分批喂养bepaly买球条件下存在于模型宿主CHO细胞系中的lncRNA,并将不同lncRNA的表达相互关联。研究人员证明,小鼠微阵列适用于检测和分析数千个CHO-lncRNA,并通过qrt-pcr验证了其中的一些基因。然后进一步分析数据,以确定在生长和固定培养阶段或在分批和分批培养之间表达变化最大的那些lncRNA。为进一步的功能研究确定潜bepaly买球在的lncRNA靶点,研究其在控制CHO细胞生长中的作用。研究人员讨论了这个丰富的数据集的出版所带来的影响,以及社区如何使用它。

实验工作流程总结

LNCRNA

在第4天和第7天分别测定了CHO-S细胞系的生长和培养活力,并采集了用于提取RNA的样品。样本在一个包含所有编码和非编码转录物存储在主要公共数据库中的小鼠阵列上进行分析。测量的强度被对数标准化和差异表达的转录物/基因被过滤以获得折叠变化bepaly买球(fc)≥2和fdr≤0.10。通过RT-qpcr(辅助材料)验证了一组选定的基因。由于CHO中lncrnas的注释不好,bepaly买球确定具有所述生物学作用的潜在目标需要比较人类和小鼠的文献和数据库,接着与中国仓鼠基因组对齐,引导到预测lncrnas转录物和之前未注释基因组bepaly买球区域(表1)。在同一时间,Go并在mRNAs上实施路径富集。

维生素D,小厘米。(2018) 分批和分批饲养条件bepaly买球下CHO细胞长的非编码RNA转录组结构. 生物技术学报[印刷前电子版]。[ 摘要]

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