用微阵列分析法鉴定肝细胞癌长非编码RNA表达谱

哺乳动物基因组中有数千个长的非编码RNA(lncrnas)。bepaly买球这些RNA代表了涉及广泛生物学功能的普遍基因的一个重要子集。lncrnas的异常表达与多种癌症有关。bepaly买球在这里,为了探讨潜在的lncRNAs参与肝细胞癌(HCC)的发生,bepaly买球研究人员吉林大学,采用微阵列技术对3对人肝癌及邻近非肿瘤组织进行了lncrna基因表达谱分析。

用含有33个bepaly买球045 bepaly买球lncrnas和30,215编码文本。生物信息学分析(基因本体,路径和网络分析)被用于进一步研究这些差异表达的mRNAs。用qrt-pcr对19对肝癌及其邻近正常组织进行分析。研究人员发现,与邻近的NT组织相比,8个lncRNa在HCC中异常bepaly买球表达。与微阵列数据一致。

他们鉴定了214个lncrnas和338bepaly买球个mrnas在所有三个HCC组织中异常表达(折叠变化≥2.0,p<0.05,fdr<0.05),用全基因组lncRNas和mRNas表达谱分析。bepaly买球构建了lncrna基因共表达网络。可用于预测lncrnas的靶基因。bepaly买球此外,我们第一次证明BC017743,ENST00000395084标准,编号026591,nr015378和nr024284上调,鉴于Nr027151,19对HCC样本中AK056988和UC003YQB.1与相邻NT样本相比下调。七个lncrnas的表达与它们附近的编码bepaly买球基因显著相关。总之,这些结果表明,肝细胞癌中lncRNA的表达谱发生了显著变化。并且一系列新的与肝癌相关的lncRNas被鉴定出来。bepaly买球这些结果为研究肝细胞癌发病机制提供了重要依据。bepaly买球

  • Zhu J刘斯是的,F,沈洋,艾迪,等。(2014)用微阵列分析法鉴定肝细胞癌长非编码RNA表达谱.PLoS一号9(7):E101707。[文章]

用微阵列分析法鉴定肝细胞癌长非编码RNA表达谱

哺乳动物基因组中有数千个长的非编码RNA(lncrnas)。bepaly买球这些RNA代表了涉及广泛生物学功能的普遍基因的一个重要子集。lncrnas的异常表达与多种癌症有关。bepaly买球在这里,为了探讨潜在的lncRNAs参与肝细胞癌(HCC)的发生,bepaly买球研究人员吉林大学,采用微阵列技术对3对人肝癌及邻近非肿瘤组织进行了lncrna基因表达谱分析。

用含有33个bepaly买球045 bepaly买球lncrnas和30,215编码文本。生物信息学分析(基因本体,路径和网络分析)被用于进一步研究这些差异表达的mRNAs。用qrt-pcr对19对肝癌及其邻近正常组织进行分析。研究人员发现,与邻近的NT组织相比,8个lncRNa在HCC中异常bepaly买球表达。与微阵列数据一致。

他们鉴定了214个lncrnas和338bepaly买球个mrnas在所有三个HCC组织中异常表达(折叠变化≥2.0,p<0.05,fdr<0.05),用全基因组lncRNas和mRNas表达谱分析。bepaly买球构建了lncrna基因共表达网络。可用于预测lncrnas的靶基因。bepaly买球此外,我们第一次证明BC017743,ENST00000395084标准,编号026591,nr015378和nr024284上调,鉴于Nr027151,19对HCC样本中AK056988和UC003YQB.1与相邻NT样本相比下调。七个lncrnas的表达与它们附近的编码bepaly买球基因显著相关。总之,这些结果表明,肝细胞癌中lncRNA的表达谱发生了显著变化。并且一系列新的与肝癌相关的lncRNas被鉴定出来。bepaly买球这些结果为研究肝细胞癌发病机制提供了重要依据。bepaly买球

  • Zhu J刘斯是的,F,沈洋,艾迪,等。(2014)用微阵列分析法鉴定肝细胞癌长非编码RNA表达谱.PLoS一号9(7):E101707。[文章]

留下答复

您的电子邮件地址将不会发布。已标记必需字段*

*